反馈这问题的基本上都是阿里云的，
apt-get purge python-virtualenv python3-virtualenv virtualenv
pip install --upgrade pip pip install virtualenv 编辑 /bin/lnmp 查找 /bin/certbot certonly 替换为 /bin/certbot --no-bootstrap certonly 再重新运行 lnmp ssl add 添加域名就可以了
话说： 我的机子没有编辑 /bin/lnmp 就直接可以生成了。
这里有详细说明：https://bbs.vpser.net/thread-16253-1-1.html#pid50671